Merkez, 9 Temmuz 2017 tarih ve 30119 sayılı Resmî Gazete'de yayımlanan "Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi Nadir Hastalıklar ve Yetim İlaçlar Uygulama ve Araştırma Merkezi Yönetmeliği" ile kurulmuştur.
Özet
| Madde | Konu |
| Madde 1-4 | Amaç, kapsam, dayanak ve tanımlar |
| Madde 5 | Merkezin amaçları: eğitim ve etkinlik düzenlemek; kamu, özel sektör ve sivil toplum arasında işbirliği sağlamak; bilgi ve veri birikimi oluşturmak; ulusal ve uluslararası referans ağlarına katılmak; güncel veri tabanlarının Türkçe kaynak olarak kullanımına katkı sunmak. |
| Madde 6 | Faaliyet alanları: danışmanlık ve eğitim hizmeti, yayın, ulusal ve uluslararası düzeyde eğitim programı, kurs, seminer ve konferans düzenlenmesi ve koordinasyonu. |
| Madde 7-9 | Yönetim organları ve Merkez Müdürünün görevleri (üç yıllık görevlendirme, en fazla iki müdür yardımcısı) |
| Madde 10-11 | Merkez Yönetim Kurulunun oluşumu (üç yıl görev süresi, ayda en az bir toplantı) ve görevleri |
| Madde 12 | Merkez Danışma Kurulunun oluşumu (en az sekiz üye, üç yıl görev süresi, yılda en az bir toplantı) ve görevleri |
| Madde 13-16 | Personel ihtiyacı, harcama yetkilisi, yürürlük ve yürütme |
Yönetmeliğin tam metni bu belgenin sonunda EK-1 olarak verilmiştir.

